Hastanemiz 4 Nisan 1963 yılında 334 fiili yatak kapasitesi ile Yunus Emre DevletHastanesi olarak hizmete açılmıştır. Ana bina 6 katlıdır. Tüm poliklinik hizmetlerinin verildiği 1200 m2 alan üzerine kurulu 6 katlı ek poliklinik bina inşaatının temeli 1990 yılında atılmış ve 1994 yılında hizmete açılmıştır. 1988 yılında yatak sayısı 504’e çıkartılan hastanemizin halen 670 fiili yatağı mevcuttur.
Hastanemiz 104.243,42 m2’lik bir alanda kurulu olup, ilimiz ve çevre illerden gelen hastalara tüm ana branşların yanısıra 1 hemodiyaliz ünitesi, 1 kardiyoloji ünitesi, 1 beyin cerrahi yoğun bakım ünitesi, 1 tomografi merkezi, hastanemize bağlı 1 semt polikliniği ile sağlık hizmeti vermektedir.
Gelişmiş tıbbi tekniklere sahip hastanemizde Laparoskopik Cerrahi, Plastik ve Rekonstrüktif Cerrahi, Beyin Cerrahi, Çocuk Cerrahi, Endoskopi, Gastroskopi, Rektoskopi, Göğüs Kalp Damar Cerrahi, Perkütan Transmülan Coroner Anjiyografi, Geçici ve Kalıcı Pacemaker, Elektro Fizyoloji gibi ileri tıbbi girişimler yapılmaktadır.
Biokimya, Mikrobiyoloji, Eliza, Hematoloji, Kan Bankası, Patoloji, Ultrason, Röntgen Laboratuarı ve Tomografi Merkezi ile ileri tetkik ve ihtiyaçların karşılandığı hastanemizde ayrıca sözleşmeli görüntüleme merkezi ile Manyetik Rözanans, Ultrasonografi, Renkli Doopler Kemik Dansitometre, Dijital Röntgen ve Mamografi çekimleri yapılmaktadır. 
Yunus Emre Devlet Hastanesi; yıllık ortalama 800.000 poliklinik hastası, 30.000 yatan hasta, 10.000 ameliyat, 150.000 acil poliklinik muayenesi ile yalnız Eskişehir'in değil, Türkiye'nin önde gelen sağlık kurumları arasında yer almaktadır.